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湖北股票配资 Sentieon 项目文章 | 一例中国男童及139例Pearson综合征患者的临床和遗传特征_研究_reads_线粒体
发布日期:2025-08-17 22:39    点击次数:161

湖北股票配资 Sentieon 项目文章 | 一例中国男童及139例Pearson综合征患者的临床和遗传特征_研究_reads_线粒体

关键词:线粒体DNA;皮尔逊综合征;多系统遗传病;

引言

皮尔逊综合征(Pearson Syndrome,PS)是一种由线粒体DNA缺失引起的罕见多系统遗传病,主要影响骨髓和胰腺功能。该病通常在婴儿早期发病,以难治性贫血为主要表现,并逐渐累及多个器官系统。由于PS多为散发病例,临床表型复杂多样,且缺乏大样本的系统性研究,给临床诊断和治疗带来挑战。

为此,研究团队对一例中国男童PS病例进行了临床特征分析和基因检测,通过线粒体全基因组测序和全外显子测序明确了患者的遗传学病因,并分析了突变与临床表型的关联。通过文献检索收集139例PS病例资料,系统总结了该疾病的临床表现谱系和遗传特征。

在数据分析过程中,研究团队使用Sentieon将核基因组reads比对到hg19。将线粒体基因组的reads比对到hg38。

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研究发现该病具有显著的临床异质性:86.2%的患者以难治性贫血起病,其次为消化系统症状(26.9%)和生长发育迟缓(15.4%)。随病程进展可累及多个系统,包括骨髓衰竭(100%)、代谢紊乱(61.87%)、胃肠道症状(61.87%)等。外周血中线粒体DNA突变的异质性程度与预后密切相关。

图1 文献介绍

今天给大家带来的是发表在frontiers期刊,被引用13次的“Case Report: Clinical and Genetic Characteristics of Pearson Syndrome in a Chinese Boy and 139 Patients”

研究材料与方法

样本:一名出生体重为2.5千克的男性儿童患者;文献检索收集的139例PS病例。

图2 病例筛选流程图

研究方法

全外显子测序和全线粒体基因组测序分析

抽取儿童与父母4毫升静脉血构建DNA文库,使用Illumina HiSeq X ten进行150bp的双端测序,cutadaptor过滤低质量reads,使用sentieon将核基因组的clean reads比对到hg19,将线粒体基因组的clean reads比对到hg38;去处重复读段,GATK进行核基因组、线粒体基因组SNV和INDEL检测,使用CNVkit计算相对拷贝数。

图3 Sentieon的作用

Sentieon是一款高效的生物信息分析软件,覆盖从原始测序数据到变异检测的完整分析流程。针对不同类型的检测提供了专业的分析方案:胚系突变检测:DNAseq和DNAscope流程;体细胞突变检测:TNseq和TNscope流程;

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研究结果

患者症状

患者首次入院时的特异性表现为发热,伴有中性粒细胞和血小板减少。骨髓穿刺显示骨髓增生明显活跃,巨核细胞成熟受损。

17个月大入院时病情加重,出现了一系列严重的神经系统症状,包括癫痫发作和昏迷。同时还出现低血糖、血氨升高等代谢紊乱,以及心肌损伤的表现。并出现四肢肌力下降至III级,无法行走的运动功能障碍。

第三次入院主要表现是神经系统症状,表现为瞳孔对光反射减弱,且胰腺外分泌功能持续降低。

患者三次入院期间持续存在贫血、代谢性异常(表现为高乳酸血症)以及肝功能异常,会反复出现呕吐和胰腺功能异常。

图4 患者的主要临床特征

(A) 骨髓穿刺显示骨髓增生明显活跃,巨核细胞成熟受损

(B) 大脑DWI图像。弥散加权成像(DWI)显示左枕叶线性高信号

基因检测结果

全外显子测序未检测到突变,线粒体DNA测序显示在chrM: 6,224-9,287区域有3.063kb的缺失,包括部分MT-CO1、全部MT-TS1、MT-TD、MT-CO2、MT-TK、MT-ATP8、MT-ATP6、MT-CO3,母亲未携带相同突变,该突变此前未被报道和发表,认为这是一个新发突变。

患者基本信息

在性别分布方面,131例患者中包括71名男性和60名女性,男女比例约为1.18:1。

在发病年龄方面,128例患者中,54例在出生后1个月内发病,其次是1-6个月龄有41例。

在确诊时间上,105例患者中仅有8例在1个月龄内确诊,大多数患者(60例)在1岁后才得到确诊。

从发病到确诊的时间间隔分析显示,在103例患者中,最常见的是1-3年,共有27例,少于1个月的有23例。

在预后方面,130例有记录结局的患者中,死亡率超50%(69例)。其中,17例在1岁内死亡,32例在1-3岁期间死亡,20例在3岁后死亡。值得注意的是,在存活的病例中有2例发展为克尔尼-塞尔综合征(KSS)。

在67例记录了妊娠和出生史的患者中,4例早产,7例宫内生长受限,5例宫内窘迫,2例羊水胎粪污染,2例妊娠期羊水过少。

在家族史方面,57例中有4例存在相关家族史,包括1例母亲被诊断为进行性外眼肌麻痹(PEO),1例家庭前三胎死亡,1例母亲和祖母有震颤,1例同胞有PS家族史。另有1例报告了无关家族史,即父亲的叔叔有婴儿猝死综合征。

初始疾病症状

130例有明确的初始症状。最常见的症状为需要反复输血的难治性贫血,共112例,其中27例为合并中性粒细胞减少或血小板减少,58例以贫血为初始症状,35例有胃肠道症状(呕吐、腹泻和喂养困难),,20例生长发育迟缓,19例有代谢紊乱(代谢性酸中毒、高乳酸血症、低血糖和电解质紊乱),8例有胰腺外分泌功能不全。

疾病治疗过程的症状

所有患者都存在骨髓衰竭,表现为伴或不伴中性粒细胞减少和(或)血小板减少的难治性贫血。

有86例出现代谢紊乱和胃肠道症状,68例生长发育迟缓,59例肾脏疾病,55例胰腺外分泌功能不全,47例反复感染,33例眼部和肢体肌肉功能障碍导致的视觉受损,42例中枢神经系统受累,28例心脏疾病,25例糖尿病。患者随病程进展伴随着并发症,如肾脏疾病、心脏疾病等。

图5 139例患者的疾病特征

(A) Pearson综合征患者的发病年龄和从发病到确诊的时间

(B) 患者观察到的初始症状的百分比

(C) 疾病过程中观察到的症状百分比 a指腹泻和呕吐 b指甲状腺功能减退、生长激素缺乏和肾上腺功能不全

(D) 死亡组和存活组外周血线粒体突变异质性的比较 死亡组外周血线粒体DNA突变的平均异质性(76.29 ± 11.86%, n = 29)显著高于存活组(59.92 ± 23.87%, n = 26; t = 3.272, p < 0.01,左图) 对于4.977 kb缺失的患者(右图),死亡组外周血线粒体DNA突变基因的平均异质性(79.64 ± 9.71%, n = 11)显著高于存活组(56.67 ± 27.65%, n = 9) (t = 2.58, p < 0.05) 误差线代表死亡组和存活组外周血异质性的标准差

线粒体DNA突变

共135例线粒体DNA突变,均为异质性突变,其中8例除异质性缺失外还有重复;30例为4.977 kb缺失,105例为其他线粒体DNA突变。缺失位点在nt.6074与nt.16082间,涉及的基因包括MT-CO1、MT-TS1、MT-TD、MT-CO2、MT-TK、MT-ATP8、MT-ATP6、MT-CO3、MT-TG、MT-ND3、MT-TR、MT-ND4L、MT-ND4、MT-TH、MT-TS2、MT-TL2、MT-ND5、MT-ND6、MT-TE、MT-CYB、MT-TT和MT-TP。

图6 患者的线粒体DNA突变

对儿童血液中线粒体DNA突变的分析显示存在3.063 kb (nt 6,224–9,287)的异质性缺失

线粒体DNA缺失异质性

85例检测到外周血和/或骨髓的异质性,在20-100%间。外周血中mtDNA缺失的异质性、外周血中4.977kb缺失的异质性与发病年龄之间均无显著相关性。死亡组外周血中mtDNA突变的平均异质性显著高于存活组。对于4.977kb缺失的患者,死亡组外周血中mtDNA突变基因的平均异质性高于存活组。

图7 外周血线粒体DNA缺失的异质性与发病年龄的相关性

图8 外周血4.977 kb缺失的异质性与发病年龄的相关性

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研究背景与遗传特征

Pearson综合征是一种由线粒体DNA异质性缺失引起的母系遗传疾病。该疾病多为散发性,在已报告的139例中,仅57例提供了家族史,其中只有5例具有明确的家族史。由于基因异质性的特点,即使在同胞之间也会表现出不同的临床特征。

发病特点与初始表现

该病可在胎儿期即已发病,表现为贫血性胎儿水肿和心脏肥大。42.2%的患者在出生后1个月内发病,但诊断时间通常在1岁以后,表明存在诊断延迟的普遍现象。难治性贫血是最常见的初始表现。其他初始症状包括胃肠道症状、代谢紊乱和胰腺功能异常。

疾病进展与并发症

随着疾病进展,患者会出现多系统受累。几乎都会出现血液系统异常,包括贫血、中性粒细胞减少和血小板减少。骨髓检查可见环形铁粒幼红细胞或骨髓前体细胞空泡化,但早期可能难以发现这些特征性改变。

基因突变特征

发现3.063 kb的新发异质性缺失,外周血中的异质性为75%。最常见的是4.977 kb缺失突变,占22.2%,而其他不常见缺失占77.8%。研究发现,死亡组患者外周血中的线粒体异质性显著高于存活组,提示异质性程度可能与预后相关。

预后分析与临床启示

该病预后较差,死亡率达52.3%,多发生在3岁以下。主要死因包括感染后的代谢危象和多系统衰竭。

总结

研究丰富了PS综合征的线粒体基因突变谱系和临床特征。除血液系统和胰腺功能障碍外,PS综合征还有较高的胃肠道和肾小管疾病发生率湖北股票配资,外周血中的异质性程度与预后相关。

发布于:日本

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